ในฐานะที่เป็นหน่วยงานที่ขับเคลื่อนระบบนิเวศนวัตกรรมของประเทศ ภายใต้บทบาท “ผู้กำหนดทิศทางนวัตกรรม (Focal Conductor)” ที่มุ่งเน้นเชื่อมโยงการทำงานร่วมกับพันธมิตรทั้งในประเทศและต่างประเทศ เพื่อส่งเสริมและสนับสนุนวิสาหกิจฐานนวัตกรรมในทุกมิติ อันจะนำไปสู่การสร้างผลกระทบทั้งด้านเศรษฐกิจและสังคมของประเทศอย่างยั่งยืน ผ่านความร่วมมือกับหน่วยงานต่างๆ ทั้งภาครัฐและเอกชนในระบบนิเวศ เพื่อขับเคลื่อนระบบนิเวศนวัตกรรมของประเทศ ผ่านเครื่องมือ 4 กลไกหลัก “Groom-Grant-Growth-Global” ได้แก่

1. Groom การพัฒนาขีดความสามารถและศักยภาพทางนวัตกรรมของวิสาหกิจฐานนวัตกรรม
2. Grant สนับสนุนเงินทุนสำหรับพัฒนาต้นแบบระดับอุตสาหกรรมให้สามารถออกสู่เชิงพาณิชย์ และขยายผลออกสู่ตลาด
3. Growth สร้างโอกาสการขยายธุรกิจให้เติบโต และต่อยอดการลงทุน
4. Global ส่งเสริมผู้ประกอบการนวัตกรรมออกสู่ตลาดต่างประเทศ

โดยได้มุ่งเน้นส่งเสริมนวัตกรรม 5 กลุ่มอุตสาหกรรมเป้าหมาย ได้แก่

1. เกษตรและอาหาร
2. การแพทย์และสุขภาพ
3. สมาร์ทอิเล็กทรอนิกส์ ปัญญาประดิษฐ์ หุ่นยนต์ และไอโอที
4. พลังงานและสิ่งแวดล้อม
5. ท่องเที่ยวและซอฟต์พาวเวอร์

เพื่อเร่งขับเคลื่อนระบบเศรษฐกิจของประเทศให้เพิ่มความสามารถในการแข่งขัน สนช. จึงได้ริเริ่มโครงการพัฒนาศูนย์กลางนวัตกรรมประเทศไทย (Thailand Innovation Hub) เพื่อมุ่งเน้นการพัฒนาอุตสาหกรรมเป้าหมายและนวัตกรรมเชิงพื้นที่ ในการสนับสนุนการสร้างสรรค์และสร้างโอกาสความร่วมมือด้านนวัตกรรมให้เกิดขึ้น โดยเน้นการเชื่อมโยงระหว่างหน่วยงานภาครัฐ ภาคเอกชน และสถาบันการศึกษา ส่งเสริมให้เกิดการกระจายโอกาสของนวัตกรรม ตลอดจนสามารถตอบโจทย์ของการพัฒนาระบบนิเวศนวัตกรรม ก่อให้เกิดการขับเคลื่อนเศรษฐกิจฐานนวัตกรรม (Innovation-Driven Economy) และสร้างศักยภาพการแข่งขันในระดับนานาชาติ